El presupuesto de egresos de la federación (PEF) para 2012 asciende a 3 billones 706 mil 922 millones de pesos, de los cuales finalmente se destinaron 59 mil 373 millones 959 mil 679 pesos para Programas de Ciencia, Tecnología e Innovación.

Al supuesto incremento nominal del Proyecto del Ejecutivo en CTI, la Comisión del rubro en la Cámara de Diputados había integrado previamente un dictamen que incorporó las necesidades de diferentes sectores relacionados con el quehacer del conocimiento, donde solicitaba aumentar de 8 mil 112 millones al gasto en la materia. Finalmente la ampliación resultó de 2 mil 909 millones 500 mil pesos, un estimado de 18.6 por ciento más con respecto al ejercicio de 2011.